Клеточные модели в лаборатории
Клеточная линия TYPK-1
TYPK-1 — опухолевая клеточная линия человека. В записи CVCL_4V78 исходный биоматериал обозначен как «лимфатический узел». Связанное с образцом заболевание в справочнике — «протоковая аденокарцинома поджелудочной железы».
Из какого материала получена культура
Обозначение «лимфатический узел» описывает место или материал, из которого получена культура TYPK-1. В исходной записи стоит пометка Metastatic. В этом случае место взятия материала может отличаться от локализации первичной опухоли. При сравнении моделей одного органа происхождение очага нужно уточнять отдельно.
Что учитывать в эксперименте
Опухолевая культура позволяет изучать свойства клеточной популяции вне исходной ткани. При переносе результатов обращают внимание на среду, длительность культивирования, номер пассажа и способ измерения ответа. Условия монослоя и тканевое микроокружение дают разные основания для интерпретации наблюдений.
Что означает время удвоения
Для TYPK-1 в работе PMID 26124327 указано время удвоения 22,1 ч. В простой модели экспоненциального роста за два таких интервала, то есть примерно за 44.2 ч, численность увеличилась бы в четыре раза. Эта оценка предполагает одинаковые условия и постоянную скорость деления. Лаг-фаза после пересева и замедление роста при высокой плотности могут изменить результат.
Как сопоставить публикации
Для материала «лимфатический узел» описана и другая культура — 1074-mel (CVCL_GR77). Для неё указано «меланома». Совпадение места забора не делает эти линии взаимозаменяемыми. При выборе модели сопоставляют исходную патологию и измеряемый экспериментальный признак. Для сопоставления с каталогом коллекции есть дополнительный ориентир — JCRB JCRB1500.
Справочные данные
- Обозначение
- TYPK-1
- Идентификатор Cellosaurus
- CVCL_4V78
- Организм
- Homo sapiens
- Материал
- лимфатический узел
- Категория культуры
- опухолевая клеточная линия
- Публикации (PMID)
- 26124327
- Связанное заболевание
- протоковая аденокарцинома поджелудочной железы
- Коллекции и каталожные номера
- JCRB JCRB1500
- Время удвоения в цитируемой работе
- 22,1 ч (PMID 26124327)
Cellosaurus 57.0, CVCL_4V78 · SIB Swiss Institute of Bioinformatics · CC BY 4.0