Клеточные модели в лаборатории
Клеточная линия TYPK-2
TYPK-2 — опухолевая клеточная линия человека. В записи CVCL_4V79 исходный биоматериал обозначен как «асцитическая жидкость». Связанное с образцом заболевание в справочнике — «протоковая аденокарцинома поджелудочной железы».
Из какого материала получена культура
Обозначение «асцитическая жидкость» описывает место или материал, из которого получена культура TYPK-2. В исходной записи стоит пометка Metastatic. В этом случае место взятия материала может отличаться от локализации первичной опухоли. При сравнении моделей одного органа происхождение очага нужно уточнять отдельно.
Что учитывать в эксперименте
Опухолевая культура позволяет изучать свойства клеточной популяции вне исходной ткани. При переносе результатов обращают внимание на среду, длительность культивирования, номер пассажа и способ измерения ответа. Условия монослоя и тканевое микроокружение дают разные основания для интерпретации наблюдений.
Что означает время удвоения
Для TYPK-2 в работе PMID 26124327 указано время удвоения 40,4 ч. В простой модели экспоненциального роста за два таких интервала, то есть примерно за 80.8 ч, численность увеличилась бы в четыре раза. Эта оценка предполагает одинаковые условия и постоянную скорость деления. Лаг-фаза после пересева и замедление роста при высокой плотности могут изменить результат.
Как сопоставить публикации
Для материала «асцитическая жидкость» описана и другая культура — 15233_nov (CVCL_JY32). Для неё указано «серозная аденокарцинома яичника высокой степени злокачественности». Совпадение места забора не делает эти линии взаимозаменяемыми. При выборе модели сопоставляют исходную патологию и измеряемый экспериментальный признак. Для сопоставления с каталогом коллекции есть дополнительный ориентир — JCRB JCRB1708.
Справочные данные
- Обозначение
- TYPK-2
- Идентификатор Cellosaurus
- CVCL_4V79
- Организм
- Homo sapiens
- Материал
- асцитическая жидкость
- Категория культуры
- опухолевая клеточная линия
- Публикации (PMID)
- 26124327
- Связанное заболевание
- протоковая аденокарцинома поджелудочной железы
- Коллекции и каталожные номера
- JCRB JCRB1708
- Время удвоения в цитируемой работе
- 40,4 ч (PMID 26124327)
Cellosaurus 57.0, CVCL_4V79 · SIB Swiss Institute of Bioinformatics · CC BY 4.0