Флуорохромы
6-carboxyfluorescein succinimidyl ester
6-carboxyfluorescein succinimidyl ester — флуорохром. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «N-hydroxysuccinimide ester». Для неё указаны формула C25H15NO9 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
Для регистрации флуоресценции учитывают две полосы спектра. Источник должен возбуждать молекулу, а фильтр детектора должен пропускать излучение образца. Яркость зависит также от растворителя, концентрации и условий наблюдения. Поэтому для выбора фильтра нужны спектральные данные именно выбранного красителя.
Как прочитать формулу и массу
Формула C25H15NO9 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 25, H — 15, N — 1, O — 9. Средняя масса составляет 473.393 Да, а моноизотопная масса — 473.07468 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 6-carboxyfluorescein succinimidyl ester равно 10 мкмоль/л, то для формы C25H15NO9 это приблизительно 4,73393 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
При сверке лабораторного стандарта сначала сопоставляют название 6-carboxyfluorescein succinimidyl ester и формулу C25H15NO9, затем проверяют полный InChIKey. Отдельно читают паспорт образца: чистота, растворитель, концентрация и условия хранения относятся к конкретной партии. Эти сведения отсутствуют в структурном идентификаторе.
Справочные данные
- Международное название
- 6-carboxyfluorescein succinimidyl ester
- Класс ChEBI
- N-hydroxysuccinimide ester
- Формула
- C25H15NO9
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 473.393
- Моноизотопная масса, Да
- 473.07468
- InChIKey
- VDABVNMGKGUPEY-UHFFFAOYSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- carboxyfluorescein N-hydroxysuccinimide ester, carboxyfluorescein succinimidyl ester, CFSE
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:132203 · EMBL-EBI · CC BY 4.0