Клиническая биохимия
lugdunin
lugdunin — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «гомодетные циклические пептиды». Для неё указаны формула C40H62N8O6S и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C40H62N8O6S задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 40, H — 62, N — 8, O — 6, S — 1. Средняя масса составляет 783.053 Да, а моноизотопная масса — 782.4513 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание lugdunin равно 10 мкмоль/л, то для формы C40H62N8O6S это приблизительно 7,83053 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В том же классе «homodetic cyclic peptide» описано другое соединение — malacidin A с формулой C56H88N12O20. Общая классификация удобна для поиска родственных веществ. При переносе результата эксперимента важно сравнить формулы, обозначения и точную структуру исследованного материала.
Справочные данные
- Международное название
- lugdunin
- Класс ChEBI
- homodetic cyclic peptide
- Формула
- C40H62N8O6S
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 783.053
- Моноизотопная масса, Да
- 782.4513
- InChIKey
- QZNGYMKAHFFKCJ-ZBQZSICZSA-N
- Химическая группа
- гомодетные циклические пептиды
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:133127 · EMBL-EBI · CC BY 4.0