Клиническая биохимия
5(S),6(S)-epoxy-18(S)-hydroxy-(7E,9E,11Z,14Z,16E)-icosapentaenoic acid
5(S),6(S)-epoxy-18(S)-hydroxy-(7E,9E,11Z,14Z,16E)-icosapentaenoic acid — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «5(S),6(S)-epoxy-18-hydroxy-(7E,9E,11Z,14Z,16E)-icosapentaenoic acid». Для неё указаны формула C20H28O4 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C20H28O4 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 20, H — 28, O — 4. Средняя масса составляет 332.44 Да, а моноизотопная масса — 332.19876 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 5(S),6(S)-epoxy-18(S)-hydroxy-(7E,9E,11Z,14Z,16E)-icosapentaenoic acid равно 10 мкмоль/л, то для формы C20H28O4 это приблизительно 3,3244 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 5(S),6(S)-epoxy-18(S)-hydroxy-(7E,9E,11Z,14Z,16E)-icosapentaenoic acid — сопряжённая кислота для «5(S),6(S)-epoxy-18(S)-hydroxy-(7E,9E,11Z,14Z,16E)-icosapentaenoate». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 5(S),6(S)-epoxy-18(S)-hydroxy-(7E,9E,11Z,14Z,16E)-icosapentaenoic acid
- Класс ChEBI
- 5(S),6(S)-epoxy-18-hydroxy-(7E,9E,11Z,14Z,16E)-icosapentaenoic acid
- Формула
- C20H28O4
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 332.44
- Моноизотопная масса, Да
- 332.19876
- InChIKey
- ZPAJZAMPZXISSE-FQNQZZNVSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- 18(S)-hydroxy-5(S),6(S)-EpEPE
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:137021 · EMBL-EBI · CC BY 4.0