Клиническая биохимия
5-hydroxybenzimidazole
5-hydroxybenzimidazole — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «benzimidazoles». Для неё указаны формула C7H6N2O и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C7H6N2O задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 7, H — 6, N — 2, O — 1. Средняя масса составляет 134.138 Да, а моноизотопная масса — 134.04801 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 5-hydroxybenzimidazole равно 10 мкмоль/л, то для формы C7H6N2O это приблизительно 1,34138 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В том же классе «benzimidazoles» описано другое соединение — hydroxyfenbendazole с формулой C15H13N3O3S. Общая классификация удобна для поиска родственных веществ. При переносе результата эксперимента важно сравнить формулы, обозначения и точную структуру исследованного материала.
Справочные данные
- Международное название
- 5-hydroxybenzimidazole
- Класс ChEBI
- benzimidazoles
- Формула
- C7H6N2O
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 134.138
- Моноизотопная масса, Да
- 134.04801
- InChIKey
- KRKSOBREFNTJJY-UHFFFAOYSA-N
- CAS RN
- 41292-65-3
- Другие обозначения в ChEBI
- 1H-benzimidazol-5-ol, 1H-benzimidazol-5-ol, 5-hydroxy-1H-benzimidazole, benzimidazol-5-ol
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:137404 · EMBL-EBI · CC BY 4.0