Клиническая биохимия
(6E,8Z)-5-oxooctadecadienoic acid
(6E,8Z)-5-oxooctadecadienoic acid — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «длинноцепочечные жирные кислоты». Для неё указаны формула C18H30O3 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C18H30O3 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 18, H — 30, O — 3. Средняя масса составляет 294.435 Да, а моноизотопная масса — 294.21949 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание (6E,8Z)-5-oxooctadecadienoic acid равно 10 мкмоль/л, то для формы C18H30O3 это приблизительно 2,94435 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В том же классе «long-chain fatty acid» описано другое соединение — (13S,14S)-epoxy-(4Z,7Z,9E,11E,16Z,19Z)-docosahexaenoic acid с формулой C22H30O3. Общая классификация удобна для поиска родственных веществ. При переносе результата эксперимента важно сравнить формулы, обозначения и точную структуру исследованного материала.
Справочные данные
- Международное название
- (6E,8Z)-5-oxooctadecadienoic acid
- Класс ChEBI
- long-chain fatty acid
- Формула
- C18H30O3
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 294.435
- Моноизотопная масса, Да
- 294.21949
- InChIKey
- YVWMHFYOIJMUMN-HSINTONASA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- (6E,8Z)-5-oxooctadeca-6,8-dienoic acid, (6E,8Z)-5-oxooctadeca-6,8-dienoic acid, 5-oxo-(6E,8Z)-octadecadienoic acid, 5-oxo-ODE
- Химическая группа
- длинноцепочечные жирные кислоты
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:137754 · EMBL-EBI · CC BY 4.0