Клиническая биохимия
(13R)-S-cysteinylglycinyl-(14S)-hydroxy-(4Z,7Z,9E,11E,16Z,19Z)-docosahexaenoic acid
(13R)-S-cysteinylglycinyl-(14S)-hydroxy-(4Z,7Z,9E,11E,16Z,19Z)-docosahexaenoic acid — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «докозаноиды». Для неё указаны формула C27H40N2O6S и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C27H40N2O6S задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 27, H — 40, N — 2, O — 6, S — 1. Средняя масса составляет 520.692 Да, а моноизотопная масса — 520.26071 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание (13R)-S-cysteinylglycinyl-(14S)-hydroxy-(4Z,7Z,9E,11E,16Z,19Z)-docosahexaenoic acid равно 10 мкмоль/л, то для формы C27H40N2O6S это приблизительно 5,20692 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: (13R)-S-cysteinylglycinyl-(14S)-hydroxy-(4Z,7Z,9E,11E,16Z,19Z)-docosahexaenoic acid — сопряжённая кислота для «(13R)-glycinylcystein-S-yl-(14S)-hydroxy-(4Z,7Z,9E,11E,16Z,19Z)-docosahexaenoate(1-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- (13R)-S-cysteinylglycinyl-(14S)-hydroxy-(4Z,7Z,9E,11E,16Z,19Z)-docosahexaenoic acid
- Класс ChEBI
- docosanoid
- Формула
- C27H40N2O6S
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 520.692
- Моноизотопная масса, Да
- 520.26071
- InChIKey
- CPBQPRBQBDLLLA-VZUSUAOUSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- MCTR2
- Химическая группа
- докозаноиды
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:138206 · EMBL-EBI · CC BY 4.0