Биотрансформация веществ
2-[(9S,11R)-epidioxy-(15S)-hydroxy-(5Z,13E)-prostadienoyl]-sn-glycero-3-phosphoethanolamine
2-[(9S,11R)-epidioxy-(15S)-hydroxy-(5Z,13E)-prostadienoyl]-sn-glycero-3-phosphoethanolamine — метаболит ксенобиотика у человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «вторичные аллильные спирты». Для неё указаны формула C25H44NO10P и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
Ксенобиотик поступает в организм извне, а при биотрансформации могут возникать несколько продуктов. Обнаружение одного продукта оценивают с учётом материала, метода идентификации и времени отбора. Для установления исходного вещества нужна документированная связь между структурами.
Как прочитать формулу и массу
Формула C25H44NO10P задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 25, H — 44, N — 1, O — 10, P — 1. Средняя масса составляет 549.598 Да, а моноизотопная масса — 549.27028 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 2-[(9S,11R)-epidioxy-(15S)-hydroxy-(5Z,13E)-prostadienoyl]-sn-glycero-3-phosphoethanolamine равно 10 мкмоль/л, то для формы C25H44NO10P это приблизительно 5,49598 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 2-[(9S,11R)-epidioxy-(15S)-hydroxy-(5Z,13E)-prostadienoyl]-sn-glycero-3-phosphoethanolamine — таутомер соединения «2-[(9S,11R)-epidioxy-(15S)-hydroxy-(5Z,13E)-prostadienoyl]-sn-glycero-3-phosphoethanolamine zwitterion». Такое сопоставление требует структурного описания. Одна эмпирическая формула не передаёт всех различий между формами.
Справочные данные
- Международное название
- 2-[(9S,11R)-epidioxy-(15S)-hydroxy-(5Z,13E)-prostadienoyl]-sn-glycero-3-phosphoethanolamine
- Класс ChEBI
- secondary allylic alcohol
- Формула
- C25H44NO10P
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 549.598
- Моноизотопная масса, Да
- 549.27028
- InChIKey
- JORBVYOHRWCTFB-GONZANLZSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- 2-(prostaglandin H2)-LPE, 2-(prostaglandin H2)-sn-glycero-3-phosphoethanolamine
- Химическая группа
- вторичные аллильные спирты
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:138745 · EMBL-EBI · CC BY 4.0