Биотрансформация веществ
prostaglandin J3
prostaglandin J3 — метаболит ксенобиотика у человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «вторичные аллильные спирты». Для неё указаны формула C20H28O4 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
Ксенобиотик поступает в организм извне, а при биотрансформации могут возникать несколько продуктов. Обнаружение одного продукта оценивают с учётом материала, метода идентификации и времени отбора. Для установления исходного вещества нужна документированная связь между структурами.
Как прочитать формулу и массу
Формула C20H28O4 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 20, H — 28, O — 4. Средняя масса составляет 332.44 Да, а моноизотопная масса — 332.19876 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание prostaglandin J3 равно 10 мкмоль/л, то для формы C20H28O4 это приблизительно 3,3244 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: prostaglandin J3 — сопряжённая кислота для «prostaglandin J3(1-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- prostaglandin J3
- Класс ChEBI
- secondary allylic alcohol
- Формула
- C20H28O4
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 332.44
- Моноизотопная масса, Да
- 332.19876
- InChIKey
- DIBKBAMSPPKSTJ-BAILPSPNSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- (5Z,9Z,13E,15S,17Z)-15-hydroxy-11-oxoprostatetraenoic acid, 15S-hydroxy-11-oxo-5Z,9Z,13E,17Z-prostatetraenoic acid, PGJ3
- Химическая группа
- вторичные аллильные спирты
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:140267 · EMBL-EBI · CC BY 4.0