Клиническая биохимия
11beta-PGE2
11beta-PGE2 — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «диолы». Для неё указаны формула C20H32O5 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C20H32O5 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 20, H — 32, O — 5. Средняя масса составляет 352.471 Да, а моноизотопная масса — 352.22497 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 11beta-PGE2 равно 10 мкмоль/л, то для формы C20H32O5 это приблизительно 3,52471 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В выборке есть ещё одно соединение с формулой C20H32O5 — 8-epi-prostaglandin E2. Структурные ключи этих записей различаются. Поиск только по формуле объединит оба результата. Чтобы выбрать нужное соединение для сравнения, проверяют полное название и структурный идентификатор.
Справочные данные
- Международное название
- 11beta-PGE2
- Класс ChEBI
- diol
- Формула
- C20H32O5
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 352.471
- Моноизотопная масса, Да
- 352.22497
- InChIKey
- XEYBRNLFEZDVAW-YUOXZBOXSA-N
- CAS RN
- 38310-90-6
- Другие обозначения в ChEBI
- 11-epi PGE2, 11-epi-prostaglandin E2
- Химическая группа
- диолы
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:140932 · EMBL-EBI · CC BY 4.0