Клиническая биохимия
gondamide
gondamide — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «primary fatty amide». Для неё указаны формула C20H39NO и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C20H39NO задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 20, H — 39, N — 1, O — 1. Средняя масса составляет 309.538 Да, а моноизотопная масса — 309.30316 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание gondamide равно 10 мкмоль/л, то для формы C20H39NO это приблизительно 3,09538 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В том же классе «primary fatty amide» описано другое соединение — oleamide с формулой C18H35NO. Общая классификация удобна для поиска родственных веществ. При переносе результата эксперимента важно сравнить формулы, обозначения и точную структуру исследованного материала.
Справочные данные
- Международное название
- gondamide
- Класс ChEBI
- primary fatty amide
- Формула
- C20H39NO
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 309.538
- Моноизотопная масса, Да
- 309.30316
- InChIKey
- LBHQTVBKPMHICN-KTKRTIGZSA-N
- CAS RN
- 10436-08-5
- Другие обозначения в ChEBI
- (11Z)-11-eicosenamide, (11Z)-11-icosenamide, (11Z)-eicosenamide, (11Z)-icos-11-enamide
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:146167 · EMBL-EBI · CC BY 4.0