Клиническая биохимия
3-carboxy-1-hydroxypropylthiamine diphosphate
3-carboxy-1-hydroxypropylthiamine diphosphate — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «1,3-thiazolium cation». Для неё указаны формула C16H25N4O10P2S и формальный заряд 1.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C16H25N4O10P2S задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 16, H — 25, N — 4, O — 10, P — 2, S — 1. Средняя масса составляет 527.409 Да, а моноизотопная масса — 527.07611 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 3-carboxy-1-hydroxypropylthiamine diphosphate равно 10 мкмоль/л, то для формы C16H25N4O10P2S это приблизительно 5,27409 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
При сверке лабораторного стандарта сначала сопоставляют название 3-carboxy-1-hydroxypropylthiamine diphosphate и формулу C16H25N4O10P2S, затем проверяют полный InChIKey. Отдельно читают паспорт образца: чистота, растворитель, концентрация и условия хранения относятся к конкретной партии. Эти сведения отсутствуют в структурном идентификаторе.
Справочные данные
- Международное название
- 3-carboxy-1-hydroxypropylthiamine diphosphate
- Класс ChEBI
- 1,3-thiazolium cation
- Формула
- C16H25N4O10P2S
- Формальный заряд
- 1
- Средняя масса, Да
- 527.409
- Моноизотопная масса, Да
- 527.07611
- InChIKey
- ZWUKRGPVMMTMAF-UHFFFAOYSA-O
- Другие обозначения в ChEBI
- 2-(3-carboxy-1-hydroxypropyl)thiamine diphosphate, 3-Carboxy-1-hydroxypropyl-ThPP
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:1463 · EMBL-EBI · CC BY 4.0