Клиническая биохимия
beta-casochemotide-1
beta-casochemotide-1 — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «олигопептиды». Для неё указаны формула C29H41N5O9 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C29H41N5O9 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 29, H — 41, N — 5, O — 9. Средняя масса составляет 603.673 Да, а моноизотопная масса — 603.29043 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание beta-casochemotide-1 равно 10 мкмоль/л, то для формы C29H41N5O9 это приблизительно 6,03673 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: beta-casochemotide-1 — сопряжённая кислота для «beta-casochemotide-1(1-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- beta-casochemotide-1
- Класс ChEBI
- oligopeptide
- Формула
- C29H41N5O9
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 603.673
- Моноизотопная масса, Да
- 603.29043
- InChIKey
- WRNQQFNBEUKAAX-YGQNSOCVSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- H-Tyr-Pro-Val-Glu-Pro-OH, L-Tyr-L-Pro-L-Val-L-Glu-L-Pro, L-tyrosyl-L-prolyl-L-valyl-L-alpha-glutamyl-L-proline, L-tyrosyl-L-prolyl-L-valyl-L-alpha-glutamyl-L-proline
- Химическая группа
- олигопептиды
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:149657 · EMBL-EBI · CC BY 4.0