Клиническая биохимия
choline
choline — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «cholines». Для неё указаны формула C5H14NO и формальный заряд 1.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C5H14NO задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 5, H — 14, N — 1, O — 1. Средняя масса составляет 104.173 Да, а моноизотопная масса — 104.10699 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание choline равно 10 мкмоль/л, то для формы C5H14NO это приблизительно 1,04173 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
При сверке лабораторного стандарта сначала сопоставляют название choline и формулу C5H14NO, затем проверяют полный InChIKey. Отдельно читают паспорт образца: чистота, растворитель, концентрация и условия хранения относятся к конкретной партии. Эти сведения отсутствуют в структурном идентификаторе.
Справочные данные
- Международное название
- choline
- Класс ChEBI
- cholines
- Формула
- C5H14NO
- Формальный заряд
- 1
- Средняя масса, Да
- 104.173
- Моноизотопная масса, Да
- 104.10699
- InChIKey
- OEYIOHPDSNJKLS-UHFFFAOYSA-N
- CAS RN
- 62-49-7
- Другие обозначения в ChEBI
- 2-hydroxy-N,N,N-trimethylethanaminium, 2-hydroxy-N,N,N-trimethylethanaminium, Bilineurine, CHOLINE ION
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:15354 · EMBL-EBI · CC BY 4.0