Клиническая биохимия
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranosyl-(1->3)-beta-D-galactopyranosyl-(1->4)-D-glucopyranose
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranosyl-(1->3)-beta-D-galactopyranosyl-(1->4)-D-glucopyranose — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «amino trisaccharide». Для неё указаны формула C20H35NO16 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C20H35NO16 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 20, H — 35, N — 1, O — 16. Средняя масса составляет 545.491 Да, а моноизотопная масса — 545.19558 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranosyl-(1->3)-beta-D-galactopyranosyl-(1->4)-D-glucopyranose равно 10 мкмоль/л, то для формы C20H35NO16 это приблизительно 5,45491 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
При сверке лабораторного стандарта сначала сопоставляют название 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranosyl-(1->3)-beta-D-galactopyranosyl-(1->4)-D-glucopyranose и формулу C20H35NO16, затем проверяют полный InChIKey. Отдельно читают паспорт образца: чистота, растворитель, концентрация и условия хранения относятся к конкретной партии. Эти сведения отсутствуют в структурном идентификаторе.
Справочные данные
- Международное название
- 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranosyl-(1->3)-beta-D-galactopyranosyl-(1->4)-D-glucopyranose
- Класс ChEBI
- amino trisaccharide
- Формула
- C20H35NO16
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 545.491
- Моноизотопная масса, Да
- 545.19558
- InChIKey
- CRTJRHPGCOAOQC-UNAKRXNOSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- GlcNAc(b1-3)Gal(b1-4)Glc, GlcNAc(beta1->3)Gal(beta1->4)Glc
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:154925 · EMBL-EBI · CC BY 4.0