Клиническая биохимия
D-alanine
D-alanine — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «alanine». Для неё указаны формула C3H7NO2 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C3H7NO2 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 3, H — 7, N — 1, O — 2. Средняя масса составляет 89.094 Да, а моноизотопная масса — 89.04768 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание D-alanine равно 10 мкмоль/л, то для формы C3H7NO2 это приблизительно 0,89094 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: D-alanine — сопряжённое основание для «D-alaninium». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- D-alanine
- Класс ChEBI
- alanine
- Формула
- C3H7NO2
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 89.094
- Моноизотопная масса, Да
- 89.04768
- InChIKey
- QNAYBMKLOCPYGJ-UWTATZPHSA-N
- CAS RN
- 338-69-2
- Другие обозначения в ChEBI
- (2R)-2-aminopropanoic acid, (R)-2-aminopropanoic acid, (R)-alanine, D-2-Aminopropionic acid
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:15570 · EMBL-EBI · CC BY 4.0