Клиническая биохимия
(S)-malate(2-)
(S)-malate(2-) — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «malate(2-)». Для неё указаны формула C4H4O5 и формальный заряд -2.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C4H4O5 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 4, H — 4, O — 5. Средняя масса составляет 132.071 Да, а моноизотопная масса — 132.00697 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание (S)-malate(2-) равно 10 мкмоль/л, то для формы C4H4O5 это приблизительно 1,32071 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: (S)-malate(2-) — сопряжённое основание для «(S)-malic acid». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- (S)-malate(2-)
- Класс ChEBI
- malate(2-)
- Формула
- C4H4O5
- Формальный заряд
- -2
- Средняя масса, Да
- 132.071
- Моноизотопная масса, Да
- 132.00697
- InChIKey
- BJEPYKJPYRNKOW-REOHCLBHSA-L
- Другие обозначения в ChEBI
- (2S)-2-hydroxybutanedioate, (2S)-2-hydroxybutanedioate, (S)-malate, L-malate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:15589 · EMBL-EBI · CC BY 4.0