Клиническая биохимия
13(S)-HPODE
13(S)-HPODE — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «13-HPODE». Для неё указаны формула C18H32O4 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C18H32O4 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 18, H — 32, O — 4. Средняя масса составляет 312.45 Да, а моноизотопная масса — 312.23006 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 13(S)-HPODE равно 10 мкмоль/л, то для формы C18H32O4 это приблизительно 3,1245 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 13(S)-HPODE — сопряжённая кислота для «13(S)-HPODE(1-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 13(S)-HPODE
- Класс ChEBI
- 13-HPODE
- Формула
- C18H32O4
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 312.45
- Моноизотопная масса, Да
- 312.23006
- InChIKey
- JDSRHVWSAMTSSN-IRQZEAMPSA-N
- CAS RN
- 33964-75-9
- Другие обозначения в ChEBI
- (9Z,11E)-(13S)-13-Hydroperoxyoctadeca-9,11-dienoate, (9Z,11E)-(13S)-13-Hydroperoxyoctadeca-9,11-dienoic acid, (9Z,11E,13S)-13-hydroperoxyoctadeca-9,11-dienoic acid, (9Z,11E,13S)-13-hydroperoxyoctadeca-9,11-dienoic acid
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:15655 · EMBL-EBI · CC BY 4.0