Клиническая биохимия
L-homoserine
L-homoserine — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «homoserine». Для неё указаны формула C4H9NO3 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C4H9NO3 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 4, H — 9, N — 1, O — 3. Средняя масса составляет 119.12 Да, а моноизотопная масса — 119.05824 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание L-homoserine равно 10 мкмоль/л, то для формы C4H9NO3 это приблизительно 1,1912 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: L-homoserine — таутомер соединения «L-homoserine zwitterion». Такое сопоставление требует структурного описания. Одна эмпирическая формула не передаёт всех различий между формами.
Справочные данные
- Международное название
- L-homoserine
- Класс ChEBI
- homoserine
- Формула
- C4H9NO3
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 119.12
- Моноизотопная масса, Да
- 119.05824
- InChIKey
- UKAUYVFTDYCKQA-VKHMYHEASA-N
- CAS RN
- 672-15-1
- Другие обозначения в ChEBI
- (2S)-2-amino-4-hydroxybutanoic acid, 2-Amino-4-hydroxybutanoic acid, 2-Amino-4-hydroxybutyric acid, Homoserine
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:15699 · EMBL-EBI · CC BY 4.0