Клиническая биохимия
O-phospho-L-serine
O-phospho-L-serine — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «O-phosphoserine». Для неё указаны формула C3H8NO6P и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C3H8NO6P задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 3, H — 8, N — 1, O — 6, P — 1. Средняя масса составляет 185.072 Да, а моноизотопная масса — 185.00892 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание O-phospho-L-serine равно 10 мкмоль/л, то для формы C3H8NO6P это приблизительно 1,85072 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: O-phospho-L-serine — сопряжённая кислота для «O-phosphonato-L-serine(2-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- O-phospho-L-serine
- Класс ChEBI
- O-phosphoserine
- Формула
- C3H8NO6P
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 185.072
- Моноизотопная масса, Да
- 185.00892
- InChIKey
- BZQFBWGGLXLEPQ-REOHCLBHSA-N
- CAS RN
- 407-41-0
- Другие обозначения в ChEBI
- (+)-L-serine dihydrogen phosphate (ester), (2S)-2-amino-3-(phosphonooxy)propanoic acid, (S)-2-amino-3-hydroxypropanoic acid 3-phosphate, 3-Phosphoserine
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:15811 · EMBL-EBI · CC BY 4.0