Клиническая биохимия
1-pyrroline-5-carboxylate
1-pyrroline-5-carboxylate — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «1-pyrrolinecarboxylate». Для неё указаны формула C5H6NO2 и формальный заряд -1.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C5H6NO2 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 5, H — 6, N — 1, O — 2. Средняя масса составляет 112.108 Да, а моноизотопная масса — 112.0404 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 1-pyrroline-5-carboxylate равно 10 мкмоль/л, то для формы C5H6NO2 это приблизительно 1,12108 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 1-pyrroline-5-carboxylate — сопряжённое основание для «1-pyrroline-5-carboxylic acid». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 1-pyrroline-5-carboxylate
- Класс ChEBI
- 1-pyrrolinecarboxylate
- Формула
- C5H6NO2
- Формальный заряд
- -1
- Средняя масса, Да
- 112.108
- Моноизотопная масса, Да
- 112.0404
- InChIKey
- DWAKNKKXGALPNW-UHFFFAOYSA-M
- Другие обозначения в ChEBI
- 3,4-dihydro-2H-pyrrole-2-carboxylate, 3,4-dihydro-2H-pyrrole-2-carboxylate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:15893 · EMBL-EBI · CC BY 4.0