Клиническая биохимия
(R)-5-diphosphomevalonic acid
(R)-5-diphosphomevalonic acid — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «carboxyalkyl phosphate». Для неё указаны формула C6H14O10P2 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C6H14O10P2 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 6, H — 14, O — 10, P — 2. Средняя масса составляет 308.116 Да, а моноизотопная масса — 308.00622 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание (R)-5-diphosphomevalonic acid равно 10 мкмоль/л, то для формы C6H14O10P2 это приблизительно 3,08116 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: (R)-5-diphosphomevalonic acid — сопряжённая кислота для «(R)-5-diphosphonatomevalonate(4-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- (R)-5-diphosphomevalonic acid
- Класс ChEBI
- carboxyalkyl phosphate
- Формула
- C6H14O10P2
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 308.116
- Моноизотопная масса, Да
- 308.00622
- InChIKey
- SIGQQUBJQXSAMW-ZCFIWIBFSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- (R)-5-Diphosphomevalonate, (R)-5-diphosphomevalonate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:15899 · EMBL-EBI · CC BY 4.0