Клиническая биохимия
5-oxoproline
5-oxoproline — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «oxoproline». Для неё указаны формула C5H7NO3 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C5H7NO3 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 5, H — 7, N — 1, O — 3. Средняя масса составляет 129.115 Да, а моноизотопная масса — 129.04259 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 5-oxoproline равно 10 мкмоль/л, то для формы C5H7NO3 это приблизительно 1,29115 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 5-oxoproline — сопряжённая кислота для «5-oxoprolinate». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 5-oxoproline
- Класс ChEBI
- oxoproline
- Формула
- C5H7NO3
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 129.115
- Моноизотопная масса, Да
- 129.04259
- InChIKey
- ODHCTXKNWHHXJC-UHFFFAOYSA-N
- CAS RN
- 149-87-1
- Другие обозначения в ChEBI
- 2-pyrrolidone-5-carboxylic acid, 5-oxo-DL-proline
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:16010 · EMBL-EBI · CC BY 4.0