Клиническая биохимия
1-piperideine-2-carboxylate
1-piperideine-2-carboxylate — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «piperidinecarboxylate». Для неё указаны формула C6H8NO2 и формальный заряд -1.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C6H8NO2 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 6, H — 8, N — 1, O — 2. Средняя масса составляет 126.135 Да, а моноизотопная масса — 126.05605 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 1-piperideine-2-carboxylate равно 10 мкмоль/л, то для формы C6H8NO2 это приблизительно 1,26135 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 1-piperideine-2-carboxylate — сопряжённое основание для «1-piperideine-2-carboxylic acid». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 1-piperideine-2-carboxylate
- Класс ChEBI
- piperidinecarboxylate
- Формула
- C6H8NO2
- Формальный заряд
- -1
- Средняя масса, Да
- 126.135
- Моноизотопная масса, Да
- 126.05605
- InChIKey
- GEJXSVNGWOSZPC-UHFFFAOYSA-M
- Другие обозначения в ChEBI
- 1,2-didehydropipecolate, 1,2-didehydropiperidine-2-carboxylate, 3,4,5,6-tetrahydropyridine-2-carboxylate, 3,4,5,6-tetrahydropyridine-2-carboxylate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:16187 · EMBL-EBI · CC BY 4.0