Клиническая биохимия
oxaloacetate(2-)
oxaloacetate(2-) — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «oxo dicarboxylic acid dianion». Для неё указаны формула C4H2O5 и формальный заряд -2.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C4H2O5 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 4, H — 2, O — 5. Средняя масса составляет 130.055 Да, а моноизотопная масса — 129.99132 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание oxaloacetate(2-) равно 10 мкмоль/л, то для формы C4H2O5 это приблизительно 1,30055 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: oxaloacetate(2-) — сопряжённое основание для «oxaloacetic acid». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- oxaloacetate(2-)
- Класс ChEBI
- oxo dicarboxylic acid dianion
- Формула
- C4H2O5
- Формальный заряд
- -2
- Средняя масса, Да
- 130.055
- Моноизотопная масса, Да
- 129.99132
- InChIKey
- KHPXUQMNIQBQEV-UHFFFAOYSA-L
- CAS RN
- 149-63-3
- Другие обозначения в ChEBI
- 2-oxobutanedioate, 2-oxobutanedioate, oxalacetate, oxaloacetate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:16452 · EMBL-EBI · CC BY 4.0