Клиническая биохимия
meso-2,6-diaminopimelic acid
meso-2,6-diaminopimelic acid — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «2,6-diaminopimelic acid». Для неё указаны формула C7H14N2O4 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C7H14N2O4 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 7, H — 14, N — 2, O — 4. Средняя масса составляет 190.199 Да, а моноизотопная масса — 190.09536 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание meso-2,6-diaminopimelic acid равно 10 мкмоль/л, то для формы C7H14N2O4 это приблизительно 1,90199 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: meso-2,6-diaminopimelic acid — сопряжённая кислота для «meso-2,6-diaminopimelate(2-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- meso-2,6-diaminopimelic acid
- Класс ChEBI
- 2,6-diaminopimelic acid
- Формула
- C7H14N2O4
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 190.199
- Моноизотопная масса, Да
- 190.09536
- InChIKey
- GMKMEZVLHJARHF-SYDPRGILSA-N
- CAS RN
- 922-54-3
- Другие обозначения в ChEBI
- (2R*,6S*)-2,6-diaminoheptanedioic acid, (2R*,6S*)-2,6-diaminoheptanedioic acid, meso-diaminoheptanedioic acid
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:16488 · EMBL-EBI · CC BY 4.0