Клиническая биохимия
L-tryptophanamide
L-tryptophanamide — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «амиды аминокислот». Для неё указаны формула C11H13N3O и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C11H13N3O задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 11, H — 13, N — 3, O — 1. Средняя масса составляет 203.245 Да, а моноизотопная масса — 203.10586 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание L-tryptophanamide равно 10 мкмоль/л, то для формы C11H13N3O это приблизительно 2,03245 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: L-tryptophanamide — сопряжённое основание для «L-tryptophanamide(1+)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- L-tryptophanamide
- Класс ChEBI
- amino acid amide
- Формула
- C11H13N3O
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 203.245
- Моноизотопная масса, Да
- 203.10586
- InChIKey
- JLSKPBDKNIXMBS-VIFPVBQESA-N
- CAS RN
- 20696-57-5
- Другие обозначения в ChEBI
- (2S)-2-amino-3-(1H-indol-3-yl)propanamide, (2S)-2-amino-3-(1H-indol-3-yl)propanamide, (S)-alpha-Amino-1H-indole-3-propionamide, L-tryptophan amide
- Химическая группа
- амиды аминокислот
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:16533 · EMBL-EBI · CC BY 4.0