Клиническая биохимия
4-methylthio-2-oxobutanoate
4-methylthio-2-oxobutanoate — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «omega-(methylthio)-2-oxocarboxylate». Для неё указаны формула C5H7O3S и формальный заряд -1.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C5H7O3S задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 5, H — 7, O — 3, S — 1. Средняя масса составляет 147.175 Да, а моноизотопная масса — 147.01214 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 4-methylthio-2-oxobutanoate равно 10 мкмоль/л, то для формы C5H7O3S это приблизительно 1,47175 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 4-methylthio-2-oxobutanoate — сопряжённое основание для «4-methylthio-2-oxobutanoic acid». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 4-methylthio-2-oxobutanoate
- Класс ChEBI
- omega-(methylthio)-2-oxocarboxylate
- Формула
- C5H7O3S
- Формальный заряд
- -1
- Средняя масса, Да
- 147.175
- Моноизотопная масса, Да
- 147.01214
- InChIKey
- SXFSQZDSUWACKX-UHFFFAOYSA-M
- Другие обозначения в ChEBI
- 2-oxo-4-methylthiobutanoate, 4-(methylsulfanyl)-2-oxobutanoate, 4-(methylsulfanyl)-2-oxobutanoate, 4-methylsulfanyl-2-oxobutanoate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:16723 · EMBL-EBI · CC BY 4.0