Клиническая биохимия
3-dehydrocarnitinium
3-dehydrocarnitinium — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «quaternary ammonium ion». Для неё указаны формула C7H14NO3 и формальный заряд 1.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C7H14NO3 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 7, H — 14, N — 1, O — 3. Средняя масса составляет 160.193 Да, а моноизотопная масса — 160.09682 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 3-dehydrocarnitinium равно 10 мкмоль/л, то для формы C7H14NO3 это приблизительно 1,60193 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 3-dehydrocarnitinium — сопряжённая кислота для «3-dehydrocarnitine». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 3-dehydrocarnitinium
- Класс ChEBI
- quaternary ammonium ion
- Формула
- C7H14NO3
- Формальный заряд
- 1
- Средняя масса, Да
- 160.193
- Моноизотопная масса, Да
- 160.09682
- InChIKey
- YNOWULSFLVIUDH-UHFFFAOYSA-O
- CAS RN
- 10457-99-5
- Другие обозначения в ChEBI
- 3-Carboxy-N,N,N-trimethyl-2-oxo-1-propanaminium, 3-carboxy-N,N,N-trimethyl-2-oxo-1-propanaminium, 3-carboxy-N,N,N-trimethyl-2-oxopropan-1-aminium, 3-carboxy-N,N,N-trimethyl-2-oxopropan-1-aminium
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:16758 · EMBL-EBI · CC BY 4.0