Клиническая биохимия
L-serine
L-serine — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «L-alpha-amino acid». Для неё указаны формула C3H7NO3 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C3H7NO3 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 3, H — 7, N — 1, O — 3. Средняя масса составляет 105.093 Да, а моноизотопная масса — 105.04259 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание L-serine равно 10 мкмоль/л, то для формы C3H7NO3 это приблизительно 1,05093 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: L-serine — сопряжённое основание для «L-serinium». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- L-serine
- Класс ChEBI
- L-alpha-amino acid
- Формула
- C3H7NO3
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 105.093
- Моноизотопная масса, Да
- 105.04259
- InChIKey
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N
- CAS RN
- 56-45-1
- Другие обозначения в ChEBI
- (2S)-2-amino-3-hydroxypropanoic acid, (S)-(-)-serine, (S)-2-amino-3-hydroxypropanoic acid, (S)-alpha-Amino-beta-hydroxypropionic acid
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:17115 · EMBL-EBI · CC BY 4.0