Клиническая биохимия
D-ribulose
D-ribulose — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «ribulose». Для неё указаны формула C5H10O5 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C5H10O5 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 5, H — 10, O — 5. Средняя масса составляет 150.13 Да, а моноизотопная масса — 150.05282 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание D-ribulose равно 10 мкмоль/л, то для формы C5H10O5 это приблизительно 1,5013 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В выборке есть ещё одно соединение с формулой C5H10O5 — D-xylulose. Структурные ключи этих записей различаются. Поиск только по формуле объединит оба результата. Чтобы выбрать нужное соединение для сравнения, проверяют полное название и структурный идентификатор.
Справочные данные
- Международное название
- D-ribulose
- Класс ChEBI
- ribulose
- Формула
- C5H10O5
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 150.13
- Моноизотопная масса, Да
- 150.05282
- InChIKey
- ZAQJHHRNXZUBTE-NQXXGFSBSA-N
- CAS RN
- 488-84-6
- Другие обозначения в ChEBI
- D-Arabinoketose, D-Arabinulose, D-erythro-2-Pentulose, D-erythro-Pent-2-ulose
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:17173 · EMBL-EBI · CC BY 4.0