Клиническая биохимия
N(6),N(6),N(6)-trimethyl-L-lysine
N(6),N(6),N(6)-trimethyl-L-lysine — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «alpha-amino-acid cation». Для неё указаны формула C9H21N2O2 и формальный заряд 1.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C9H21N2O2 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 9, H — 21, N — 2, O — 2. Средняя масса составляет 189.279 Да, а моноизотопная масса — 189.15975 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание N(6),N(6),N(6)-trimethyl-L-lysine равно 10 мкмоль/л, то для формы C9H21N2O2 это приблизительно 1,89279 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: N(6),N(6),N(6)-trimethyl-L-lysine — таутомер соединения «N(6),N(6),N(6)-trimethyl-L-lysine zwitterion». Такое сопоставление требует структурного описания. Одна эмпирическая формула не передаёт всех различий между формами.
Справочные данные
- Международное название
- N(6),N(6),N(6)-trimethyl-L-lysine
- Класс ChEBI
- alpha-amino-acid cation
- Формула
- C9H21N2O2
- Формальный заряд
- 1
- Средняя масса, Да
- 189.279
- Моноизотопная масса, Да
- 189.15975
- InChIKey
- MXNRLFUSFKVQSK-QMMMGPOBSA-O
- CAS RN
- 19253-88-4
- Другие обозначения в ChEBI
- (S)-2-amino-6-(trimethylammonio)hexanoic acid, (S)-5-amino-5-carboxy-N,N,N-trimethyl-1-pentanaminium, epsilon-N-trimethyl-L-lysine, epsilon-trimethyl-L-lysine
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:17311 · EMBL-EBI · CC BY 4.0