Клиническая биохимия
3-hydroxy-3-methylglutarate(2-)
3-hydroxy-3-methylglutarate(2-) — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «3-hydroxydicarboxylate(2-)». Для неё указаны формула C6H8O5 и формальный заряд -2.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C6H8O5 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 6, H — 8, O — 5. Средняя масса составляет 160.125 Да, а моноизотопная масса — 160.03827 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 3-hydroxy-3-methylglutarate(2-) равно 10 мкмоль/л, то для формы C6H8O5 это приблизительно 1,60125 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 3-hydroxy-3-methylglutarate(2-) — сопряжённое основание для «3-hydroxy-3-methylglutarate(1-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 3-hydroxy-3-methylglutarate(2-)
- Класс ChEBI
- 3-hydroxydicarboxylate(2-)
- Формула
- C6H8O5
- Формальный заряд
- -2
- Средняя масса, Да
- 160.125
- Моноизотопная масса, Да
- 160.03827
- InChIKey
- NPOAOTPXWNWTSH-UHFFFAOYSA-L
- Другие обозначения в ChEBI
- 3-hydroxy-3-methylglutarate, 3-hydroxy-3-methylpentanedioate, 3-hydroxy-3-methylpentanedioate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:17325 · EMBL-EBI · CC BY 4.0