Клиническая биохимия
4-hydroxy-2-oxoglutarate(2-)
4-hydroxy-2-oxoglutarate(2-) — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «oxo dicarboxylate». Для неё указаны формула C5H4O6 и формальный заряд -2.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C5H4O6 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 5, H — 4, O — 6. Средняя масса составляет 160.081 Да, а моноизотопная масса — 160.00189 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 4-hydroxy-2-oxoglutarate(2-) равно 10 мкмоль/л, то для формы C5H4O6 это приблизительно 1,60081 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 4-hydroxy-2-oxoglutarate(2-) — сопряжённое основание для «4-hydroxy-2-oxoglutarate(1-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 4-hydroxy-2-oxoglutarate(2-)
- Класс ChEBI
- oxo dicarboxylate
- Формула
- C5H4O6
- Формальный заряд
- -2
- Средняя масса, Да
- 160.081
- Моноизотопная масса, Да
- 160.00189
- InChIKey
- WXSKVKPSMAHCSG-UHFFFAOYSA-L
- Другие обозначения в ChEBI
- 2-hydroxy-4-oxoglutarate, 2-hydroxy-4-oxopentanedioate, 2-hydroxy-4-oxopentanedioate, 2-keto-4-hydroxyglutarate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:17742 · EMBL-EBI · CC BY 4.0