Клиническая биохимия
2-phospho-D-glyceric acid
2-phospho-D-glyceric acid — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «2-phosphoglyceric acid». Для неё указаны формула C3H7O7P и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C3H7O7P задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 3, H — 7, O — 7, P — 1. Средняя масса составляет 186.056 Да, а моноизотопная масса — 185.99294 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 2-phospho-D-glyceric acid равно 10 мкмоль/л, то для формы C3H7O7P это приблизительно 1,86056 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 2-phospho-D-glyceric acid — сопряжённая кислота для «2-phosphonato-D-glycerate(3-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 2-phospho-D-glyceric acid
- Класс ChEBI
- 2-phosphoglyceric acid
- Формула
- C3H7O7P
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 186.056
- Моноизотопная масса, Да
- 185.99294
- InChIKey
- GXIURPTVHJPJLF-UWTATZPHSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- (2R)-3-hydroxy-2-(phosphonooxy)propanoic acid, (2R)-3-hydroxy-2-(phosphonooxy)propanoic acid, 2-Phospho-D-glycerate, 2-phospho-D-glycerate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:17835 · EMBL-EBI · CC BY 4.0