Клиническая биохимия
L-allysine
L-allysine — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «allysine». Для неё указаны формула C6H11NO3 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C6H11NO3 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 6, H — 11, N — 1, O — 3. Средняя масса составляет 145.158 Да, а моноизотопная масса — 145.07389 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание L-allysine равно 10 мкмоль/л, то для формы C6H11NO3 это приблизительно 1,45158 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: L-allysine — таутомер соединения «L-allysine zwitterion». Такое сопоставление требует структурного описания. Одна эмпирическая формула не передаёт всех различий между формами.
Справочные данные
- Международное название
- L-allysine
- Класс ChEBI
- allysine
- Формула
- C6H11NO3
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 145.158
- Моноизотопная масса, Да
- 145.07389
- InChIKey
- GFXYTQPNNXGICT-YFKPBYRVSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- (2S)-2-amino-6-oxohexanoic acid, (2S)-2-amino-6-oxohexanoic acid, (S)-2-Amino-6-oxohexanoate, 2-AMINO-6-OXO-HEXANOIC ACID
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:17917 · EMBL-EBI · CC BY 4.0