Клиническая биохимия
O-octanoyl-L-carnitine
O-octanoyl-L-carnitine — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «saturated fatty acyl-L-carnitine». Для неё указаны формула C15H29NO4 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C15H29NO4 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 15, H — 29, N — 1, O — 4. Средняя масса составляет 287.4 Да, а моноизотопная масса — 287.20966 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание O-octanoyl-L-carnitine равно 10 мкмоль/л, то для формы C15H29NO4 это приблизительно 2,874 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: O-octanoyl-L-carnitine — энантиомер соединения «O-octanoyl-D-carnitine». Такое сопоставление требует структурного описания. Одна эмпирическая формула не передаёт всех различий между формами.
Справочные данные
- Международное название
- O-octanoyl-L-carnitine
- Класс ChEBI
- saturated fatty acyl-L-carnitine
- Формула
- C15H29NO4
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 287.4
- Моноизотопная масса, Да
- 287.20966
- InChIKey
- CXTATJFJDMJMIY-CYBMUJFWSA-N
- CAS RN
- 25243-95-2
- Другие обозначения в ChEBI
- (3R)-3-octanoyloxy-4-(trimethylammonio)butanoate, (3R)-3-octanoyloxy-4-(trimethylammonio)butanoate, L-octanoyl-L-carnitine, L-Octanoylcarnitine
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:18102 · EMBL-EBI · CC BY 4.0