Клиническая биохимия
alpha-D-ribofuranose 5-phosphate
alpha-D-ribofuranose 5-phosphate — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «D-ribofuranose 5-phosphate». Для неё указаны формула C5H11O8P и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C5H11O8P задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 5, H — 11, O — 8, P — 1. Средняя масса составляет 230.109 Да, а моноизотопная масса — 230.01915 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание alpha-D-ribofuranose 5-phosphate равно 10 мкмоль/л, то для формы C5H11O8P это приблизительно 2,30109 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
При сверке лабораторного стандарта сначала сопоставляют название alpha-D-ribofuranose 5-phosphate и формулу C5H11O8P, затем проверяют полный InChIKey. Отдельно читают паспорт образца: чистота, растворитель, концентрация и условия хранения относятся к конкретной партии. Эти сведения отсутствуют в структурном идентификаторе.
Справочные данные
- Международное название
- alpha-D-ribofuranose 5-phosphate
- Класс ChEBI
- D-ribofuranose 5-phosphate
- Формула
- C5H11O8P
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 230.109
- Моноизотопная масса, Да
- 230.01915
- InChIKey
- KTVPXOYAKDPRHY-AIHAYLRMSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- 5-O-phosphono-alpha-D-ribofuranose, alpha-D-ribofuranose 5-(dihydrogen phosphate), alpha-D-ribofuranose 5-(dihydrogen phosphate), alpha-D-Ribose 5-phosphate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:18189 · EMBL-EBI · CC BY 4.0