Клиническая биохимия
histamine
histamine — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «imidazoles». Для неё указаны формула C5H9N3 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C5H9N3 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 5, H — 9, N — 3. Средняя масса составляет 111.148 Да, а моноизотопная масса — 111.07965 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание histamine равно 10 мкмоль/л, то для формы C5H9N3 это приблизительно 1,11148 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: histamine — сопряжённое основание для «histaminium». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- histamine
- Класс ChEBI
- imidazoles
- Формула
- C5H9N3
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 111.148
- Моноизотопная масса, Да
- 111.07965
- InChIKey
- NTYJJOPFIAHURM-UHFFFAOYSA-N
- CAS RN
- 51-45-6
- Другие обозначения в ChEBI
- .beta.-aminoethylglyoxaline, 1H-Imidazole-4-ethanamine, 2-(1H-imidazol-4-yl)ethanamine, 2-(1H-imidazol-4-yl)ethanamine
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:18295 · EMBL-EBI · CC BY 4.0