Клиническая биохимия
cobamamide
cobamamide — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «cobalamins». Для неё указаны формула C72H100CoN18O17P и формальный заряд 0. Другие роли, приведённые для той же структуры: кофактор.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C72H100CoN18O17P задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 72, H — 100, Co — 1, N — 18, O — 17, P — 1. Средняя масса составляет 1579.608 Да, а моноизотопная масса — 1578.65834 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание cobamamide равно 10 мкмоль/л, то для формы C72H100CoN18O17P это приблизительно 15,79608 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
При сверке лабораторного стандарта сначала сопоставляют название cobamamide и формулу C72H100CoN18O17P, затем проверяют полный InChIKey. Отдельно читают паспорт образца: чистота, растворитель, концентрация и условия хранения относятся к конкретной партии. Эти сведения отсутствуют в структурном идентификаторе.
Справочные данные
- Международное название
- cobamamide
- Класс ChEBI
- cobalamins
- Формула
- C72H100CoN18O17P
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 1579.608
- Моноизотопная масса, Да
- 1578.65834
- InChIKey
- ZIHHMGTYZOSFRC-OUCXYWSSSA-L
- CAS RN
- 13870-90-1
- Другие обозначения в ChEBI
- (5,6-Dimethylbenzimidazolyl)cobamide coenzyme, (5,6-dimethylbenzimidazolyl)cobamide coenzyme, 5'-Deoxy-5'-adenosyl vitamin B12, 5'-Deoxy-5'-adenosyl-5,6-dimethylbenzimidazolylcobamide
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:18408 · EMBL-EBI · CC BY 4.0