Клиническая биохимия
2-amino-3-(3-oxoprop-1-enyl)but-2-enedioic acid
2-amino-3-(3-oxoprop-1-enyl)but-2-enedioic acid — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «oxo dicarboxylic acid». Для неё указаны формула C7H7NO5 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C7H7NO5 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 7, H — 7, N — 1, O — 5. Средняя масса составляет 185.135 Да, а моноизотопная масса — 185.03242 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 2-amino-3-(3-oxoprop-1-enyl)but-2-enedioic acid равно 10 мкмоль/л, то для формы C7H7NO5 это приблизительно 1,85135 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 2-amino-3-(3-oxoprop-1-enyl)but-2-enedioic acid — сопряжённая кислота для «2-amino-3-(3-oxoprop-1-enyl)but-2-enedioate». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 2-amino-3-(3-oxoprop-1-enyl)but-2-enedioic acid
- Класс ChEBI
- oxo dicarboxylic acid
- Формула
- C7H7NO5
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 185.135
- Моноизотопная масса, Да
- 185.03242
- InChIKey
- KACPVQQHDVBVFC-UHFFFAOYSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- 2-amino-3-(3-oxoprop-1-en-1-yl)but-2-enedioic acid, 2-amino-3-(3-oxoprop-1-en-1-yl)but-2-enedioic acid
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:19448 · EMBL-EBI · CC BY 4.0