Клиническая биохимия
5-hydroxy-N-formylkynurenine
5-hydroxy-N-formylkynurenine — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «non-proteinogenic alpha-amino acid». Для неё указаны формула C11H12N2O5 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C11H12N2O5 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 11, H — 12, N — 2, O — 5. Средняя масса составляет 252.226 Да, а моноизотопная масса — 252.07462 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 5-hydroxy-N-formylkynurenine равно 10 мкмоль/л, то для формы C11H12N2O5 это приблизительно 2,52226 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В том же классе «non-proteinogenic alpha-amino acid» описано другое соединение — alpha-phenylglycine с формулой C8H9NO2. Общая классификация удобна для поиска родственных веществ. При переносе результата эксперимента важно сравнить формулы, обозначения и точную структуру исследованного материала.
Справочные данные
- Международное название
- 5-hydroxy-N-formylkynurenine
- Класс ChEBI
- non-proteinogenic alpha-amino acid
- Формула
- C11H12N2O5
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 252.226
- Моноизотопная масса, Да
- 252.07462
- InChIKey
- LSTOUSIIVKMJBU-UHFFFAOYSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- 2-amino-4-(2-formamido-5-hydroxyphenyl)-4-oxobutanoic acid, 2-amino-4-(2-formamido-5-hydroxyphenyl)-4-oxobutanoic acid
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:2065 · EMBL-EBI · CC BY 4.0