Клиническая биохимия
1-methylpyrrolinium
1-methylpyrrolinium — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «органические катионы». Для неё указаны формула C5H10N и формальный заряд 1.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C5H10N задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 5, H — 10, N — 1. Средняя масса составляет 84.142 Да, а моноизотопная масса — 84.08078 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 1-methylpyrrolinium равно 10 мкмоль/л, то для формы C5H10N это приблизительно 0,84142 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В том же классе «organic cation» описано другое соединение — clidinium с формулой C22H26NO3. Общая классификация удобна для поиска родственных веществ. При переносе результата эксперимента важно сравнить формулы, обозначения и точную структуру исследованного материала.
Справочные данные
- Международное название
- 1-methylpyrrolinium
- Класс ChEBI
- organic cation
- Формула
- C5H10N
- Формальный заряд
- 1
- Средняя масса, Да
- 84.142
- Моноизотопная масса, Да
- 84.08078
- InChIKey
- FDWZAOGDOVQOLD-UHFFFAOYSA-N
- CAS RN
- 16032-02-3
- Другие обозначения в ChEBI
- 1-methyl-3,4-dihydro-2H-pyrrolium, 1-methyl-3,4-dihydro-2H-pyrrolium, 1-methyl-Delta(1)-pyrrolinium, N-methylpyrrolinium
- Химическая группа
- органические катионы
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:27435 · EMBL-EBI · CC BY 4.0