Клиническая биохимия
prostaglandin J2
prostaglandin J2 — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «prostaglandins J». Для неё указаны формула C20H30O4 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C20H30O4 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 20, H — 30, O — 4. Средняя масса составляет 334.456 Да, а моноизотопная масса — 334.21441 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание prostaglandin J2 равно 10 мкмоль/л, то для формы C20H30O4 это приблизительно 3,34456 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: prostaglandin J2 — сопряжённая кислота для «prostaglandin J2(1-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- prostaglandin J2
- Класс ChEBI
- prostaglandins J
- Формула
- C20H30O4
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 334.456
- Моноизотопная масса, Да
- 334.21441
- InChIKey
- UQOQENZZLBSFKO-POPPZSFYSA-N
- CAS RN
- 60203-57-8
- Другие обозначения в ChEBI
- 9-Deoxy-delta-9-pgd2, 9-Deoxy-delta-9-prostaglandin D2, PGJ2
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:27485 · EMBL-EBI · CC BY 4.0