Клиническая биохимия
11-epi-prostaglandin F2alpha
11-epi-prostaglandin F2alpha — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «prostaglandins F». Для неё указаны формула C20H34O5 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C20H34O5 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 20, H — 34, O — 5. Средняя масса составляет 354.487 Да, а моноизотопная масса — 354.24062 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 11-epi-prostaglandin F2alpha равно 10 мкмоль/л, то для формы C20H34O5 это приблизительно 3,54487 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 11-epi-prostaglandin F2alpha — сопряжённая кислота для «11-epi-prostaglandin F2alpha(1-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 11-epi-prostaglandin F2alpha
- Класс ChEBI
- prostaglandins F
- Формула
- C20H34O5
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 354.487
- Моноизотопная масса, Да
- 354.24062
- InChIKey
- PXGPLTODNUVGFL-ZWAKLXPCSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- 11-epi-PGF2a, 11-epi-PGF2alpha, 11-epi-Prostaglandin F2a
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:27595 · EMBL-EBI · CC BY 4.0