Клиническая биохимия
prostaglandin B1
prostaglandin B1 — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «prostaglandins B». Для неё указаны формула C20H32O4 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C20H32O4 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 20, H — 32, O — 4. Средняя масса составляет 336.472 Да, а моноизотопная масса — 336.23006 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание prostaglandin B1 равно 10 мкмоль/л, то для формы C20H32O4 это приблизительно 3,36472 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: prostaglandin B1 — сопряжённая кислота для «prostaglandin B1(1-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- prostaglandin B1
- Класс ChEBI
- prostaglandins B
- Формула
- C20H32O4
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 336.472
- Моноизотопная масса, Да
- 336.23006
- InChIKey
- YBHMPNRDOVPQIN-VSOYFRJCSA-N
- CAS RN
- 13345-51-2
- Другие обозначения в ChEBI
- (13E,15S)-15-hydroxy-9-oxoprosta-8(12),13-dien-1-oic acid, (13E,15S)-15-hydroxy-9-oxoprosta-8(12),13-dien-1-oic acid, PGB1, PGB1
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:27624 · EMBL-EBI · CC BY 4.0