Клиническая биохимия
decanoate
decanoate — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «omega-methyl-medium-chain fatty acid anion». Для неё указаны формула C10H19O2 и формальный заряд -1.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C10H19O2 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 10, H — 19, O — 2. Средняя масса составляет 171.26 Да, а моноизотопная масса — 171.13905 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание decanoate равно 10 мкмоль/л, то для формы C10H19O2 это приблизительно 1,7126 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: decanoate — сопряжённое основание для «decanoic acid». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- decanoate
- Класс ChEBI
- omega-methyl-medium-chain fatty acid anion
- Формула
- C10H19O2
- Формальный заряд
- -1
- Средняя масса, Да
- 171.26
- Моноизотопная масса, Да
- 171.13905
- InChIKey
- GHVNFZFCNZKVNT-UHFFFAOYSA-M
- Другие обозначения в ChEBI
- 1-nonanecarboxylate, caprate, caprinate, caprynate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:27689 · EMBL-EBI · CC BY 4.0