Клиническая биохимия
L-4-hydroxyglutamic semialdehyde
L-4-hydroxyglutamic semialdehyde — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «glutamic semialdehyde». Для неё указаны формула C5H9NO4 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C5H9NO4 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 5, H — 9, N — 1, O — 4. Средняя масса составляет 147.13 Да, а моноизотопная масса — 147.05316 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание L-4-hydroxyglutamic semialdehyde равно 10 мкмоль/л, то для формы C5H9NO4 это приблизительно 1,4713 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: L-4-hydroxyglutamic semialdehyde — таутомер соединения «L-4-hydroxyglutamate semialdehyde zwitterion». Такое сопоставление требует структурного описания. Одна эмпирическая формула не передаёт всех различий между формами.
Справочные данные
- Международное название
- L-4-hydroxyglutamic semialdehyde
- Класс ChEBI
- glutamic semialdehyde
- Формула
- C5H9NO4
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 147.13
- Моноизотопная масса, Да
- 147.05316
- InChIKey
- XCXUZPXOFFRGGP-DMTCNVIQSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- (2S,4R)-2-amino-4-hydroxy-5-oxopentanoic acid, (2S,4R)-2-amino-4-hydroxy-5-oxopentanoic acid, (4R)-4-hydroxy-5-oxo-L-norvaline, 4-amino-3,4-dideoxy-D-erythro-penturonic acid
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:27809 · EMBL-EBI · CC BY 4.0