Клиническая биохимия
all-cis-icosa-8,11,14-trienoyl-CoA
all-cis-icosa-8,11,14-trienoyl-CoA — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «long-chain fatty acyl-CoA». Для неё указаны формула C41H68N7O17P3S и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C41H68N7O17P3S задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 41, H — 68, N — 7, O — 17, P — 3, S — 1. Средняя масса составляет 1056.016 Да, а моноизотопная масса — 1055.36052 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание all-cis-icosa-8,11,14-trienoyl-CoA равно 10 мкмоль/л, то для формы C41H68N7O17P3S это приблизительно 10,56016 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: all-cis-icosa-8,11,14-trienoyl-CoA — сопряжённая кислота для «(8Z,11Z,14Z)-icosatrienoyl-CoA(4-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- all-cis-icosa-8,11,14-trienoyl-CoA
- Класс ChEBI
- long-chain fatty acyl-CoA
- Формула
- C41H68N7O17P3S
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 1056.016
- Моноизотопная масса, Да
- 1055.36052
- InChIKey
- FJWJALRUNNZIBB-DDQUOPDJSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- (8Z,11Z,14Z)-eicosatrienoyl-coenzyme A, (8Z,11Z,14Z)-Icosatrienoyl-CoA, 8,11,14-Eicosatrienoyl-CoA, 8,11,14-Icosatrienoyl-CoA
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:27979 · EMBL-EBI · CC BY 4.0